ChemSpider - ChemSpider

ChemSpider
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Soddisfare
Descrizione Un database di strutture chimiche che fornisce un accesso rapido a oltre 100 milioni di strutture, proprietà e informazioni associate.
Contatto
Centro di ricerca Raleigh, North Carolina , Stati Uniti
Laboratorio
Accesso
Sito web www.chemspider.com
Utensili
Indipendente, autonomo https://itunes.apple.com/us/app/chemspider/id458878661
Varie
Licenza Attribuzione Creative Commons Condividi allo stesso modo

ChemSpider è un database di sostanze chimiche . ChemSpider è di proprietà della Royal Society of Chemistry .

Banca dati

Il database contiene informazioni su oltre 100 milioni di molecole da oltre 270 fonti di dati, tra cui:

A ogni sostanza chimica viene assegnato un identificatore univoco , che fa parte di un URL corrispondente. Ad esempio, l' acetone è 175 e quindi ha l'URL http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.175.html

Crowdsourcing

Il database ChemSpider può essere aggiornato con i contributi degli utenti, inclusa la deposizione della struttura chimica, la deposizione degli spettri e la cura dell'utente. Questo è un approccio di crowdsourcing per sviluppare un database di chimica online. La gestione dei dati basata sul crowdsourcing ha prodotto un dizionario di nomi chimici associati a strutture chimiche che è stato utilizzato nelle applicazioni di estrazione di testo della letteratura biomedica e chimica.

Tuttavia, i diritti del database non vengono rinunciati e un dump dei dati non è disponibile; infatti la FAQ afferma addirittura che sono consentiti solo download limitati: pertanto il diritto di fork non è garantito e il progetto non può essere considerato free / open .

Ricerca

Viene fornito un numero di moduli di ricerca disponibili:

  • La ricerca standard consente la ricerca di nomi sistematici , nomi commerciali , sinonimi e numeri di registro
  • La ricerca avanzata consente la ricerca interattiva per struttura chimica, sottostruttura chimica, utilizzando anche formula molecolare e intervallo di peso molecolare , numeri CAS , fornitori, ecc. La ricerca può essere utilizzata per ampliare o restringere i risultati già trovati.
  • La ricerca della struttura sui dispositivi mobili può essere eseguita utilizzando app gratuite per iOS (iPhone / iPod / iPad) e per Android (sistema operativo) .

Mark-up del documento di chimica

Il database ChemSpider è stato utilizzato in combinazione con il text mining come base del markup dei documenti di chimica . ChemMantis, il sistema integrato di trasformazione della marcatura e della nomenclatura della chimica, utilizza algoritmi per identificare ed estrarre nomi di sostanze chimiche da documenti e pagine Web e converte i nomi di sostanze chimiche in strutture chimiche utilizzando algoritmi di conversione da nome a struttura e ricerche di dizionari nel database ChemSpider. Il risultato è un sistema integrato tra documenti di chimica e ricerca di informazioni tramite ChemSpider in oltre 150 fonti di dati.

Storia

ChemSpider è stata acquisita dalla Royal Society of Chemistry (RSC) nel maggio 2009. Prima dell'acquisizione da parte di RSC, ChemSpider era controllata da una società privata, ChemZoo Inc. Il sistema è stato lanciato per la prima volta nel marzo 2007 in una versione beta e ha subito la transizione in uscita nel marzo 2008.

Servizi

In linea sono disponibili numerosi servizi. Questi includono la conversione di nomi chimici in strutture chimiche , la generazione di stringhe SMILES e InChI , nonché la previsione di molti parametri fisico-chimici e l'integrazione in un servizio web che consente la previsione NMR .

SyntheticPages

SyntheticPages è un database interattivo gratuito di procedure di chimica sintetica gestite dalla Royal Society of Chemistry . Gli utenti inviano procedure sintetiche da loro stessi condotte per la pubblicazione sul sito. Queste procedure possono essere opere originali, ma più spesso sono basate sulle reazioni della letteratura. Ove opportuno, vengono citate la procedura originale pubblicata. Sono controllati da un editore scientifico prima di essere pubblicati. Le pagine non sono sottoposte a revisione paritaria formale come un articolo di una rivista scientifica, ma i commenti possono essere inseriti dagli utenti che hanno effettuato l'accesso. I commenti sono moderati anche da editori scientifici. L'intenzione è quella di raccogliere esperienze pratiche su come condurre una sintesi chimica utile in laboratorio. Mentre i metodi sperimentali pubblicati in una normale rivista accademica sono elencati in modo formale e conciso, le procedure in ChemSpider SyntheticPages sono fornite con dettagli più pratici. L'informalità è incoraggiata. Sono inclusi anche i commenti dei mittenti. Altre pubblicazioni con quantità di dettagli comparabili includono Sintesi organiche e Sintesi inorganiche . Il sito SyntheticPages è stato originariamente creato dai professori Kevin Booker-Milburn ( Università di Bristol ), Stephen Caddick ( University College London ), Peter Scott ( Università di Warwick ) e Dr Max Hammond. Nel febbraio 2010 è stata annunciata una fusione con il motore di ricerca della struttura chimica della Royal Society of Chemistry ChemSpider e la formazione di ChemSpider | SyntheticPages (CS | SP).

Apri PHACTS

ChemSpider è stato il deposito di composti chimici nell'ambito del progetto Open PHACTS , un'iniziativa per i medicinali innovativi . Open PHACTS sviluppato per standard aperti, con un approccio web semantico ad accesso aperto per affrontare i colli di bottiglia nella scoperta di farmaci di piccole molecole: fonti di informazione disparate, mancanza di standard e sovraccarico di informazioni.

Guarda anche

Riferimenti