Collagene, tipo VI, alfa 3 - Collagen, type VI, alpha 3

COL6A3
Proteina COL6A3 PDB 1knt.png
Strutture disponibili
PDB Ricerca UniProt umana: PDBe RCSB
Identificatori
Alias COL6A3 , DYT27, BTHLM1, UCMD1, collagene tipo VI alpha 3, collagene tipo VI alpha 3 catena
ID esterni OMIM: 120250 MGI: 88461 HomoloGene: 37917 GeneCards: COL6A3
Posizione genica (umana)
Cromosoma 2 (umano)
Chr. Cromosoma 2 (umano)
Cromosoma 2 (umano)
Posizione genomica per COL6A3
Posizione genomica per COL6A3
Gruppo musicale 2q37.3 Inizio 237.324.003 bp
Fine 237.414.207 bp
Pattern di espressione dell'RNA
PBB GE COL6A3 201438 su fs.png
Più dati di espressione di riferimento
Orthologs
Specie Umano Topo
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_004369
NM_057164
NM_057165
NM_057166
NM_057167

NM_001243008
NM_001243009
NM_009935

RefSeq (proteina)

NP_004360
NP_476505
NP_476506
NP_476507
NP_476508

n / A

Posizione (UCSC) Chr 2: 237,32 - 237,41 Mb Chr 1: 90,77 - 90,84 Mb
Ricerca PubMed
Wikidata
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La catena del collagene alfa-3 (VI) è una proteina che nell'uomo è codificata dal gene COL6A3 . Questa proteina è una catena alfa del collagene di tipo VI che aiuta nella formazione di microfibrille. Come parte del collagene di tipo VI, questa proteina è stata implicata nella miopatia di Bethlem, nella distrofia muscolare congenita di Ullrich (UCMD) e in altre malattie legate ai muscoli e al tessuto connettivo.

Struttura

Questo gene codifica per la catena alfa 3, una delle tre catene alfa del collagene di tipo VI, un collagene filamentoso a perline che si trova nella maggior parte dei tessuti connettivi. La catena alfa 3 del collagene di tipo VI è molto più grande delle catene alfa 1 e 2. Questa differenza di dimensioni è in gran parte dovuta a un aumento del numero di sottodomini, simili ai domini di tipo A del fattore di von Willebrand, che si trovano nel dominio globulare amminoterminale di tutte le catene alfa. Oltre al trascritto a lunghezza intera, sono state identificate quattro varianti di trascrizione che codificano per proteine ​​con domini globulari N-terminali di dimensioni variabili.

Funzione

La catena alfa 3 di tipo VI ha dimostrato di legare le proteine ​​della matrice extracellulare, un'interazione che spiega l'importanza di questo collagene nell'organizzazione dei componenti della matrice. La formazione di microfibrille è stata ricondotta alle interazioni tra il suo sottodominio N-terminale N5 e il suo dominio C-terminale C5 in monomeri di collagene di tipo VI adiacenti.

Significato clinico

Le mutazioni nei geni del collagene di tipo VI sono associate alla miopatia di Bethlem e alla distrofia muscolare congenita di Ullrich (UCMD). Tipicamente, sia la miopatia di Bethlem che i pazienti con UCMD autosomica recessiva sono eterozigoti per mutazioni nelle tre catene alfa del collagene di tipo VI, ma solo i primi presentano sintomi. Delle tre catene alfa, le mutazioni COL6A3 contribuiscono solo al 18% dei casi di miopatia di Bethlem e UCMD. Uno studio sulle mutazioni UCMD di Zhang et al ha trovato solo una mutazione non patogena in COL6A3. Tuttavia, l'abbattimento del mutante COL6A3 nelle cellule dei fibroblasti dei pazienti utilizzando siRNA ha migliorato con successo la deposizione cellulare di collagene di tipo VI nell'UCMD autosomica dominante e potrebbe diventare un trattamento promettente per questo. Sebbene alti livelli di espressione di COL6A3 siano stati correlati con l'obesità e il diabete nei topi, questa relazione non è stata osservata negli esseri umani. Altri disturbi che coinvolgono muscoli e tessuto connettivo includono debolezza, lassità articolare e contratture e pelle anormale.

Riferimenti

Ulteriore lettura

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