HMGA1 - HMGA1

HMGA1
Strutture disponibili
PDB	Ricerca ortologa: PDBe RCSB
Elenco dei codici ID PDB
	2EZD , 2EZE , 2EZF , 2EZG
Identificatori
Alias	HMGA1 , HMG-R, HMGA1A, HMGIY, gruppo ad alta mobilità AT-hook 1
ID esterni	OMIM : 600701 MGI : 96160 Omologene : 128226 Schede Genetiche : HMGA1
Localizzazione del gene ( umano )
Cr.	Cromosoma 6 (umano)
Fine	34.246.231 bp
Localizzazione del gene ( Mouse )
Cr.	Cromosoma 17 (topo)
Fine	27.563.674 bp
Modello di espressione dell'RNA
	; ;
	Più dati sull'espressione di riferimento
Ontologia genica
Funzione molecolare	• retinoide X legame recettoriale ; • recettore dell'acido retinoico legame ; • enzima vincolante ; • proliferazione dei perossisomi recettore attivato legame ; • DNA binding ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 attività attivatore di trascrizione di legame al DNA, RNA specifico della polimerasi II ; • attività coattivatrice del recettore nucleare ; • GO:0001948 legame alle proteine ; • legame alla cromatina ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 attività del fattore di trascrizione legante il DNA ; • 5'-desossiribosio-5-fosfato liasi attività ; • fattore di trascrizione vincolante ; • DNA (sito apurinico o apyrimidinic) L'attività di endonucleasi ; • GO: rilegatura 0001158 cis-regolamentazione specifica regione del DNA-sequenza ; • solco minore di adenina-timina-ricco DNA binding ; • GO: 0.001.200, GO: 0.001.133, GO :0001201 Attività del fattore di trascrizione legante il DNA, specifico per l'RNA polimerasi II ; • GO:0001105 Attività del coattivatore della trascrizione ; • costituente strutturale della cromatina;
Componente cellulare	• nucleo ; • nucleoplasma ; • citosol ; • focus eterocromatina associato alla senescenza ; • cromosoma ; • adesione focale ; • complesso regolatore di trascrizione ; • cromatina ; • complesso regolatore di trascrizione RNA polimerasi II;
Processo biologico	• regolazione negativa della proliferazione popolazione cellulare ; • senescenza cellulare oncogene-induceva ; • costituzione integrato provirale latenza ; • nucleosoma smontaggio ; • regolazione della trascrizione, DNA-templato ; • regolazione positiva della trascrizione, DNA-templato ; • regolazione positiva della trascrizione da parte della RNA polimerasi II ; • positivo regolazione della senescenza cellulare ; • assemblaggio del fuoco dell'eterocromatina associato alla senescenza ; • regolazione negativa della trascrizione, modello DNA ; • risposta al virus ; • regolazione negativa del silenziamento della cromatina ; • svolgimento del DNA coinvolto nella replicazione del DNA ; • trascrizione, modello DNA ; • trascrizione mediante RNA polimerasi II ; • trasporto nucleare ; • GO:0022415 processo virale ; • riparazione per escissione di basi ; • assemblaggio complesso contenente proteine;
	Fonti: Amigo / QuickGO
Ortologhi
	3159
	15361
	ENSG00000137309
	ENSMUSG00000046711
	P17096
	P17095
NM_002131 ; NM_145899 ; NM_145901 ; NM_145902 ; NM_145903;
	NM_145904 ; NM_145905 ; NM_001319077 ; NM_001319078 ; NM_001319079 ; NM_001319080 ; NM_001319081 ; NM_001319082
NM_001025427 ; NM_001039356 ; NM_001166535 ; NM_001166536 ; NM_001166537;
	NM_001166539 ; NM_001166540 ; NM_001166541 ; NM_001166542 ; NM_001166543 ; NM_001166544 ; NM_001166545 ; NM_001166546 ; NM_016660
NP_001306006 ; NP_001306007 ; NP_001306008 ; NP_001306009 ; NP_001306010;
	NP_001306011 ; NP_002122 ; NP_665906 ; NP_665908 ; NP_665909 ; NP_665910 ; NP_665912
NP_001020598 ; NP_001034445 ; NP_001160007 ; NP_001160008 ; NP_001160009;
	NP_001160011 ; NP_001160012 ; NP_001160013 ; NP_001160014 ; NP_001160015 ; NP_001160016 ; NP_001160017 ; NP_001160018 ; NP_057869
	Wikidata
Visualizza/Modifica umano	Visualizza/Modifica mouse

La proteina del gruppo ad alta mobilità HMG-I/HMG-Y è una proteina che nell'uomo è codificata dal gene HMGA1 .

Funzione

Questo gene codifica per una proteina della cromatina non istonica coinvolta in molti processi cellulari, tra cui la regolazione della trascrizione genica inducibile, la replicazione del DNA, l' organizzazione dell'eterocromatina , l' integrazione dei retrovirus nei cromosomi e la progressione metastatica delle cellule tumorali.

Proteine HMGA1 sono abbastanza piccole (~ 10-12 kDa) e molecole di base, e sono composti da tre AT-ganci con il RGRP (Arg-Gly-Arg-Pro) nucleo motivo , un romanzo reticolazione dominio che si trova tra il secondo e terzo AT-hook e una caratteristica coda acida C-terminale per la famiglia HMG che comprende le proteine HMGA, HMGB e HMGN.

Le proteine di fusione HMGA1-GFP sono altamente dinamiche in vivo (determinate utilizzando l' analisi FRAP ), ma al contrario mostrano anche affinità nanomolare al DNA ricco di AT in vitro (determinato biochimicamente), che potrebbe essere spiegato a causa delle estese modificazioni post-trascrizionali in vivo . HMGA1 si lega preferenzialmente al solco minore delle regioni ricche di AT nel DNA a doppio filamento usando i suoi ganci AT. Ha poca struttura secondaria in soluzione ma assume conformazioni distinte quando è legato a substrati come DNA o altre proteine. Le proteine HMGA1 hanno elevate quantità di diverse modificazioni post-traduzionali e sono localizzate principalmente nel nucleo, specialmente nell'eterocromatina, ma anche nei mitocondri e nel citoplasma.

Recentemente è stato dimostrato che le proteine HMGA1, HMGA1a e HMGA1b, possono reticolare le fibre di DNA in vitro e possono indurre il clustering della cromatina in vivo suggerendo un ruolo strutturale delle proteine HMGA1 nell'organizzazione dell'eterocromatina.

Per questo gene sono state trovate almeno sette varianti di trascrizione codificanti due diverse isoforme (HMGA1a, HMGA1b). La variante di giunzione HMGA1c con solo due ganci AT e nessuna coda acida è in discussione per essere un vero membro della famiglia HMGA.

I topi privi della loro variante di HMGA1 , cioè i topi Hmga1-/- , sono diabetici , mostrano un'ipertrofia cardiaca ed esprimono bassi livelli del recettore dell'insulina .

Interazioni

È stato dimostrato che HMGA1 interagisce con CEBPB e con il fattore di trascrizione Sp1 .

Guarda anche

Riferimenti

Ulteriori letture

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link esterno

HMGA1+proteina,+umano presso la National Library of Medicine degli Stati Uniti Medical Subject Headings (MeSH)
Panoramica di tutte le informazioni strutturali disponibili nel PDB per UniProt : P17096 (proteina del gruppo ad alta mobilità HMG-I/HMG-Y) presso il PDBe-KB .

Questo articolo incorpora il testo della Biblioteca Nazionale di Medicina degli Stati Uniti , che è di pubblico dominio .

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