Aplogruppo del DNA mitocondriale umano - Human mitochondrial DNA haplogroup
Nella genetica umana , un aplogruppo del DNA mitocondriale umano è un aplogruppo definito dalle differenze nel DNA mitocondriale umano . Gli aplogruppi sono usati per rappresentare i principali punti di diramazione sull'albero filogenetico mitocondriale. Comprendere il percorso evolutivo del lignaggio femminile ha aiutato i genetisti della popolazione a risalire all'eredità matrilineare degli umani moderni fino alle origini umane in Africa e alla successiva diffusione in tutto il mondo.
I nomi delle lettere degli aplogruppi (non solo aplogruppi del DNA mitocondriale) vanno dalla A alla Z. Poiché gli aplogruppi sono stati nominati nell'ordine della loro scoperta, l'ordine alfabetico non ha alcun significato in termini di effettive relazioni genetiche.
L'ipotetica donna alla base di tutti questi gruppi (cioè solo gli aplogruppi del DNA mitocondriale) è l' antenato comune matrilineare più recente (MRCA) per tutti gli esseri umani attualmente viventi . È comunemente chiamata Eva mitocondriale .
La velocità con cui il DNA mitocondriale muta è nota come orologio molecolare mitocondriale . È un'area di ricerca in corso con uno studio che riporta una mutazione ogni 8000 anni.
filogenesi
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Genealogia genetica |
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Concetti |
argomenti correlati |
Questo albero filogenetico è basato su Van Oven (2009).
- L ( Eva mitocondriale )
Cronologia
aplogruppo | Est. tempo di origine ( kya ) | Possibile luogo di origine | Frequenze più alte |
---|---|---|---|
l | 200 | ||
L1-6 | 170 | Africa dell'est | |
L2-6 | 150 | Africa dell'est | |
L0 | 150 | Africa dell'est | |
L1 | 140 | Africa centrale | |
L3-6 | 130 | ||
L5 | 120 | ||
L2 | 90 | ||
L3 | 70 | Africa dell'est | |
n | 70 | Africa orientale o Asia occidentale | |
m | 60 | Africa orientale, Asia occidentale o Asia meridionale | |
R | 60 | ||
tu | 55 | Africa nord-orientale o India (Asia meridionale) | |
RT'JT | 55 | Medio Oriente | |
JT | 50 | Medio Oriente | |
U8 | 50 | Asia occidentale | |
R9 | 47 | ||
B4 | 44 | ||
F | 43 | ||
U4'9 | 42 | Asia centrale | |
U5 | 35 | Asia occidentale | |
U6 | 35 | Nord Africa | |
J | 35 | ||
X | 30 | ||
K | 30 | ||
U5a | 27 | ||
HV | 27 | Vicino Oriente | |
J1a | 27 | Vicino Oriente | |
T | 27 | Mesopotamia | |
K1 | 27 | ||
io | 26 | ||
J1 | 24 | Vicino Oriente | |
W | 20 | ||
U4 | 20 | Asia centrale | |
X2 | 20 | ||
h | 20 | Asia occidentale | |
U5a1 | 18 | Europa | |
J1b | 11 | ||
V | 14 | ||
X2a | 13 | Nord America | |
H1 | 12 | ||
H3 | 12 | ||
X1 | 10 |
Distribuzione geografica
Un documento del 2004 suggeriva che gli aplogruppi più comuni nelle moderne popolazioni europee fossero: H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X e W.
Aplogruppi africani: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a
Aplogruppi australiani: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (Rif. 1, 2, 3, 4, 5, 6)
Aplogruppi asiatici: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U molte varianti numeriche per ogni sezione
Guarda anche
- Genetica mitocondriale umana
- Genealogia genetica
- matrilinearità
- Aplogruppi del DNA del cromosoma Y umano
- Genetica di popolazione
Riferimenti
- ^ Rishishwar L, Jordan IK (2017). "Implicazioni dell'evoluzione umana e commistione per la terapia sostitutiva mitocondriale" . Genomica BMC . 18 (1): 140. doi : 10.1186/s12864-017-3539-3 . PMC 5299762 . PMID 28178941 .
- ^ Loogvali, Eva-Liis; Kivisild, Toomas; Margus, Tõnu; Villems, Richard (2009), O'Rourke, Dennis (ed.), "Spiegare l'imperfezione dell'orologio molecolare dei mitocondri ominidi", PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO...4.8260L , doi : 10.1371/journal.pone.0008260 , PMC 2794369 , PMID 20041137
- ^ Kivisild T (2015). "Ascendenza materna e storia della popolazione da interi genomi mitocondriali" . Indaga su Genet . 6 : 3. doi : 10.1186/s13323-015-0022-2 . PMC 4367903 . PMID 25798216 .
- ^ a b van Oven M, Kayser M (febbraio 2009). "Albero filogenetico completo aggiornato della variazione globale del DNA mitocondriale umano" . Mutazione umana . 30 (2): E386-94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
-
^ "Correzione per la purificazione della selezione: un supplemento dell'orologio molecolare mitocondriale umano migliorato" (PDF) . 2009: 82-83 [89]. Archiviato dall'originale (PDF) il 29-12-2009.
Citare il diario richiede
|journal=
( aiuto ) - ^ Villems, Richard; Usanga, Esien; Mikerezi, Ilia; Golge, Mukaddes; Claustres, Mireille; Michalodimitrakis, Emmanuel N.; Pappa, Kalliopi I.; Anagnou, Nicholas P.; Chaventré, André; Moisan, Jean-Paul; Richard, Christelle; Grechanina, Elena; Balanovska, Elena V.; Rudan, Pavao; Puzyrev, Valery; Stepanov, Vadim; Khusnutdinova, Elsa K.; Gusar, Vladislava; Balanovsky, Oleg P.; Peričić, Marijana; Barac, Lovorka; Golubenko, Maria; Lukina, Arina; Laos, Sirle; Pennarun, Erwan; Parik, Juri; Tolk, Helle-Viivi; Reidla, Maere; Tambets, Kristiina; Metspalu, Ene; Kivisild, Toomas; Derenko, Miroslava V.; Malyarchuk, Boris A.; Roostalu, Urmas; Loogväli, Eva-Liis (1 novembre 2004). "Uniformità disunita: una tela cladistica pezzata dell'aplogruppo H del mtDNA in Eurasia" . Biologia molecolare ed evoluzione . 21 (11): 2012–2021. doi : 10.1093/molbev/msh209 . PMID 15254257 – tramite accademico.oup.com.
link esterno
-
Alberi filogenetici mitocondriali
- Mannis van Forno di PhyloTree.org
- PhyloD3 – Albero filogenetico basato su D3.js basato su PhyloTree
- Scheletro dell'aplogruppo mitocondriale
- MitoTool: un server web per l'analisi e il recupero delle variazioni della sequenza del DNA mitocondriale umano
- HaploGrep: determinazione dell'aplogruppo del mtDNA basata su PhyloTree.org
- HaploFind – pipeline di assegnazione automatica rapida degli aplogruppi per il DNA mitocondriale umano
Albero filogenetico degli aplogruppi del DNA mitocondriale umano (mtDNA) |
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Eva mitocondriale ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
m | n | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | oh | UN | S | R | io | W | X | sì | |||||||||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | pre-JT | P | tu | ||||||||||||||||||||||||||||||||
HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
h | V | J | T |