IDH2 - IDH2

IDH2
Strutture disponibili
PDB Ricerca ortologica: PDBe RCSB
Identificatori
Alias IDH2 , D2HGA2, ICD-M, IDH, IDHM, IDP, IDPM, mNADP-IDH, isocitrato deidrogenasi (NADP (+)) 2, mitocondriale, isocitrato deidrogenasi (NADP (+)) 2
ID esterni OMIM: 147650 MGI: 96414 HomoloGene: 37590 GeneCards: IDH2
Posizione genica (umana)
Cromosoma 15 (umano)
Chr. Cromosoma 15 (umano)
Cromosoma 15 (umano)
Posizione genomica per IDH2
Posizione genomica per IDH2
Gruppo musicale 15q26.1 Inizio 90.083.045 bp
Fine 90.102.504 bp
Pattern di espressione dell'RNA
PBB GE IDH2 210045 su fs.png

PBB GE IDH2 210046 sa fs.png
Più dati di espressione di riferimento
Orthologs
Specie Umano Topo
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002168
NM_001289910
NM_001290114

NM_173011

RefSeq (proteina)

NP_001276839
NP_001277043
NP_002159

NP_766599

Posizione (UCSC) Chr 15: 90,08 - 90,1 Mb Chr 7: 80,09 - 80,12 Mb
Ricerca PubMed
Wikidata
Visualizza / Modifica umano Visualizza / Modifica mouse

L'isocitrato deidrogenasi [NADP], mitocondriale è un enzima che nell'uomo è codificato dal gene IDH2 .

Isocitrato deidrogenasi sono enzimi che catalizzano l'ossidazione decarbossilazione di isocitrate a 2-chetoglutarato . Questi enzimi appartengono a due sottoclassi distinte, una delle quali utilizza NAD (+) come accettore di elettroni e l'altra NADP (+). Sono state segnalate cinque isocitrato deidrogenasi: tre isocitrato deidrogenasi dipendenti da NAD (+), che si localizzano nella matrice mitocondriale , e due isocitrato deidrogenasi dipendenti da NADP (+), una delle quali è mitocondriale e l'altra prevalentemente citosolica . Ogni isoenzima dipendente da NADP (+) è un omodimero . La proteina codificata dal gene IDH2 è l'isocitrato deidrogenasi dipendente da NADP (+) che si trova nei mitocondri. Svolge un ruolo nel metabolismo intermedio e nella produzione di energia. Questa proteina può essere strettamente associata o interagire con il complesso piruvato deidrogenasi . Sono state trovate anche mutazioni a mosaico somatico di questo gene associate alla malattia di Ollier e alla sindrome di Maffucci .

Struttura

L'isocitrato deidrogenasi è composto da 3 subunità, regolate allostericamente e richiede uno ione Mg 2+ o Mn 2+ integrato . La forma mitocondriale di IDH, come la maggior parte delle isoforme, è un omodimero, in cui due subunità monomeriche identiche formano un'unità. La struttura di Mycobacterium tuberculosis IDH-1 legato con NADPH e Mn 2+ è stato risolto da cristallografia a raggi X . È un omodimero in cui ciascuna subunità ha una piega di Rossmann e un dominio superiore comune di fogli β ad incastro . Mtb IDH-1 è strutturalmente più simile all'IDH umano mutante R132H trovato in alcuni glioblastomi . Simile all'ICDH R132H umano, Mtb ICDH-1 catalizza anche la formazione di α-idrossiglutarato .

Funzione

L'isocitrato deidrogenasi è un enzima digestivo utilizzato nel ciclo dell'acido citrico . La sua funzione principale è quella di catalizzare la decarbossilazione ossidativa dell'isocitrato in alfa-chetoglutarato . Tuttavia, la regolazione dell'isocitrato deidrogenasi umano non è completamente compresa, è noto che NADP e Ca2 + si legano nel sito attivo per creare tre diverse conformazioni. Queste conformazioni si formano nel sito attivo e sono le seguenti: si forma un anello nell'enzima inattivo, un'elica alfa parzialmente disfatta nella forma semiaperta e un'elica alfa nella forma attiva.

Significato clinico

La forma mitocondriale di IDH2 è correlata a molte malattie. Le mutazioni in IDH2 sono associate all'aciduria 2-idrossiglutarica , una condizione che causa un danno progressivo al cervello . I principali tipi di questo disturbo sono chiamati aciduria D-2-idrossiglutarica (D-2-HGA), aciduria L-2-idrossiglutarica (L-2-HGA) e aciduria combinata D, L-2-idrossiglutarica (D, L -2-HGA). Le caratteristiche principali di D-2-HGA sono sviluppo ritardato, convulsioni, tono muscolare debole ( ipotonia ) e anomalie nella maggior parte del cervello (il cervello ), che controlla molte funzioni importanti come il movimento muscolare, la parola, la vista, pensiero, emozione e memoria. I ricercatori hanno descritto due sottotipi di D-2-HGA, tipo I e tipo II. I due sottotipi si distinguono per la causa genetica e il modello di ereditarietà, sebbene presentino anche alcune differenze nei segni e nei sintomi. Il tipo II tende ad iniziare prima e spesso causa problemi di salute più gravi rispetto al tipo I. Il tipo II può anche essere associato a un cuore indebolito e ingrossato ( cardiomiopatia ), una caratteristica che tipicamente non si trova con il tipo I. L-2-HGA in particolare colpisce una regione del cervello chiamata cervelletto, che è coinvolta nel coordinamento dei movimenti. Di conseguenza, molte persone affette hanno problemi di equilibrio e coordinazione muscolare ( atassia ). Ulteriori caratteristiche di L-2-HGA possono includere sviluppo ritardato, convulsioni, difficoltà di linguaggio e una testa insolitamente grande ( macrocefalia ). In genere, i segni e i sintomi di questo disturbo iniziano durante l'infanzia o la prima infanzia. Il disturbo peggiora nel tempo, portando solitamente a una grave disabilità all'inizio dell'età adulta. La combinazione D, L-2-HGA causa gravi anomalie cerebrali che si manifestano nella prima infanzia. I neonati affetti hanno crisi epilettiche gravi, tono muscolare debole (ipotonia) e problemi respiratori e di alimentazione. Di solito sopravvivono solo nell'infanzia o nella prima infanzia.

Le mutazioni nel gene IDH2, insieme alle mutazioni nel gene IDH1, sono anche fortemente correlate con lo sviluppo di tumori di glioma , leucemia mieloide acuta (AML), condrosarcoma , colangiocarcinoma intraepatico (ICC) e linfoma a cellule T angioimmunoblastico . Essi hanno inoltre causare aciduria D-2-hydroxyglutaric e Ollier e sindromi Maffucci . Le mutazioni IDH2 possono consentire la sopravvivenza prolungata delle cellule cancerose di glioma e ICC, ma non delle cellule AML. La ragione di ciò è sconosciuta. Mutazioni missenso nel sito attivo di questi IDH2 inducono una reazione neoenzimatica in cui NADPH riduce αKG a D-2-idrossiglutarato, che si accumula e porta all'inibizione della degradazione del fattore 1α inducibile dall'ipossia (HIF1α) (inibizione del prolil- idrossilasi ), nonché cambiamenti nell'epigenetica e nell'omeostasi della matrice extracellulare . Tali mutazioni implicano anche una minore capacità di produzione di NADPH. I tumori di vari tipi di tessuto con mutazioni IDH1 / 2 mostrano una migliore risposta alle radiazioni e alla chemioterapia.

Gli inibitori dell'attività neomorfica dei mutanti IDH1 e IDH2 sono attualmente in sperimentazione clinica di fase I / II per tumori solidi e del sangue. Poiché IDH1 e IDH2 rappresentano enzimi chiave all'interno del ciclo dell'acido tricarbossilico (TCA) , le mutazioni hanno un impatto significativo sul metabolismo intermedio. La perdita di alcune attività metaboliche wild-type è una conseguenza importante, potenzialmente deleteria e sfruttabile dal punto di vista terapeutico delle mutazioni IDH oncogene e richiede indagini continue in futuro.

Come bersaglio della droga

I farmaci che prendono di mira forme mutate di IDH2 includono:

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Modifica ciclo TCA

Riferimenti

Ulteriore lettura

link esterno

  • Panoramica di tutte le informazioni strutturali disponibili nel PDB per UniProt : P48735 (Human Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitocondrial) presso il PDBe-KB .
  • Panoramica di tutte le informazioni strutturali disponibili nel PDB per UniProt : P54071 (Mouse Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitocondrial) al PDBe-KB .