Promotore (genetica) - Promoter (genetics)

1 : RNA polimerasi, 2 : repressore, 3 : promotore, 4 : operatore, 5 : lattosio, 6 : lacZ, 7 : lacY, 8 : lacA.

In alto : La trascrizione del gene è disattivata. Non c'è lattosio per inibire il repressore , quindi il repressore si lega all'operatore , che impedisce alla RNA polimerasi di legarsi al promotore e di produrre l'mRNA che codifica il gene della lattasi.

In basso : il gene è attivato. Il lattosio inibisce il repressore, consentendo alla RNA polimerasi di legarsi al promotore ed esprimere i geni che sintetizzano la lattasi. Alla fine, la lattasi digerirà tutto il lattosio, finché non ce ne sarà più da legare al repressore. Il repressore si legherà quindi all'operatore, interrompendo la produzione di lattasi.

In genetica , un promotore è una sequenza di DNA a cui si legano le proteine ​​che avviano la trascrizione di un singolo RNA dal DNA a valle di esso. Questo RNA può codificare una proteina o può avere una funzione in sé e per sé, come tRNA , mRNA o rRNA . I promotori si trovano vicino ai siti di inizio della trascrizione dei geni, a monte del DNA (verso la regione 5' del filamento di senso ). I promotori possono essere lunghi circa 100-1000 paia di basi , la cui sequenza dipende fortemente dal gene e dal prodotto della trascrizione, dal tipo o dalla classe di RNA polimerasi reclutata nel sito e dalla specie dell'organismo.

Panoramica

Perché la trascrizione abbia luogo, l'enzima che sintetizza l'RNA, noto come RNA polimerasi , deve legarsi al DNA vicino a un gene. I promotori contengono sequenze di DNA specifiche come elementi di risposta che forniscono un sito di legame iniziale sicuro per l'RNA polimerasi e per le proteine ​​chiamate fattori di trascrizione che reclutano l'RNA polimerasi. Questi fattori di trascrizione hanno sequenze di attivatori o repressori specifici di nucleotidi corrispondenti che si attaccano a promotori specifici e regolano l'espressione genica.

Nei batteri
Il promotore è riconosciuto dalla RNA polimerasi e da un fattore sigma associato , che a loro volta sono spesso portati al DNA promotore dal legame di una proteina attivatore al proprio sito di legame del DNA nelle vicinanze.
negli eucarioti
Il processo è più complicato e sono necessari almeno sette diversi fattori per il legame di una RNA polimerasi II al promotore.

I promotori rappresentano elementi critici che possono lavorare di concerto con altre regioni regolatorie ( esaltatori , silenziatori , elementi di confine/ isolanti ) per dirigere il livello di trascrizione di un dato gene. Un promotore viene indotto in risposta ai cambiamenti nell'abbondanza o nella conformazione delle proteine ​​regolatorie in una cellula, che consentono l'attivazione di fattori di trascrizione per reclutare l'RNA polimerasi.

Identificazione della posizione relativa

Poiché i promotori sono tipicamente immediatamente adiacenti al gene in questione, le posizioni nel promotore sono designate rispetto al sito di inizio della trascrizione , dove inizia la trascrizione del DNA per un particolare gene (cioè, le posizioni a monte sono numeri negativi che contano da -1, per esempio -100 è una posizione 100 coppie di basi a monte).

Posizione relativa nel nucleo cellulare

Nel nucleo cellulare sembra che i promotori siano distribuiti preferenzialmente ai margini dei territori cromosomici, verosimilmente per la coespressione di geni su cromosomi differenti. Inoltre, nell'uomo, i promotori mostrano alcune caratteristiche strutturali caratteristiche per ciascun cromosoma.

Elementi

batterico

Nei batteri , il promotore contiene due brevi elementi di sequenza approssimativamente 10 ( Pribnow Box ) e 35 nucleotidi a monte del sito di inizio della trascrizione .

  • La sequenza a -10 (l'elemento -10) ha la sequenza di consenso TATAAT.
  • La sequenza in -35 (l'elemento -35) ha la sequenza di consenso TTGACA.
  • Le sequenze consenso di cui sopra, sebbene conservate in media, non si trovano intatte nella maggior parte dei promotori. In media, solo da 3 a 4 delle 6 coppie di basi in ciascuna sequenza consenso si trovano in un dato promotore. Finora sono stati identificati pochi promotori naturali che possiedono sequenze consenso intatte sia a -10 che a -35; è stato riscontrato che promotori artificiali con conservazione completa degli elementi -10 e -35 trascrivono a frequenze inferiori rispetto a quelli con alcune discrepanze con il consenso.
  • La spaziatura ottimale tra le sequenze -35 e -10 è di 17 bp.
  • Alcuni promotori contengono uno o più sottositi dell'elemento promotore a monte (elemento UP) ( sequenza consenso 5'-AAAAARNR-3' quando centrata nella regione -42; sequenza consenso 5'-AWWWWWTTTTT-3' quando centrata nella regione -52; W = A o T; R = A o G; N = qualsiasi base).

Le sequenze promotrici di cui sopra sono riconosciute solo dall'oloenzima della RNA polimerasi contenente sigma-70 . Gli oloenzimi della RNA polimerasi contenenti altri fattori sigma riconoscono diverse sequenze del promotore del nucleo. 

   <-- upstream                                                          downstream -->
5'-XXXXXXXPPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3'
           -35       -10       Gene to be transcribed

Probabilità di occorrenza di ciascun nucleotide

 for -10 sequence
 T    A    T    A    A   T
77%  76%  60%  61%  56%  82%

 for -35 sequence
 T    T    G    A    C    A
69%  79%  61%  56%  54%  54%

eucariotico

I promotori eucariotici sono diversi e possono essere difficili da caratterizzare, tuttavia, studi recenti mostrano che sono divisi in più di 10 classi.

Dieci classi di promotori eucariotici e dei loro modelli rappresentativi del DNA . Le classi di promotori eucariotici rappresentative sono mostrate nelle seguenti sezioni: (A) classe basata su AT, (B) classe basata su CG, (C) classe ATCG compatta, (D) classe bilanciata ATCG, (E) ATCG media classe, (F) classe senza ATCG, (G) classe senza AT, (H) classe con picchi CG, (I) classe senza CG e (J) classe ATspike.

I promotori genici si trovano tipicamente a monte del gene e possono avere elementi regolatori a diverse kilobasi di distanza dal sito di inizio della trascrizione (potenziatori). Negli eucarioti, il complesso trascrizionale può far piegare il DNA su se stesso, il che consente il posizionamento di sequenze regolatorie lontane dal sito effettivo di trascrizione. I promotori eucariotici RNA-polimerasi-II-dipendenti possono contenere una scatola TATA ( sequenza consenso TATAAA), che è riconosciuta dal fattore di trascrizione generale TATA-binding protein (TBP); e un elemento di riconoscimento B (BRE), che è riconosciuto dal fattore di trascrizione generale TFIIB . L'elemento TATA e BRE si trovano tipicamente vicino al sito di inizio della trascrizione (tipicamente entro 30-40 paia di basi).

Le sequenze regolatorie del promotore eucariotico si legano tipicamente a proteine ​​chiamate fattori di trascrizione che sono coinvolti nella formazione del complesso trascrizionale. Un esempio è l' E-box (sequenza CACGTG), che lega i fattori di trascrizione della famiglia basic helix-loop-helix (bHLH) (es. BMAL1-Clock , cMyc ). Alcuni promotori che sono presi di mira da più fattori di trascrizione potrebbero raggiungere uno stato iperattivo, portando ad un aumento dell'attività trascrizionale.

  • Promotore principale: la parte minima del promotore necessaria per avviare correttamente la trascrizione
  • Promotore prossimale – la sequenza prossimale a monte del gene che tende a contenere elementi regolatori primari
  • Promotore distale : la sequenza distale a monte del gene che può contenere elementi regolatori aggiuntivi, spesso con un'influenza più debole rispetto al promotore prossimale
    • Qualsiasi cosa più a monte (ma non un potenziatore o un'altra regione di regolamentazione la cui influenza è indipendente dalla posizione/orientamento)
    • Siti di legame per fattori di trascrizione specifici

Promotori di mammiferi

Regolazione della trascrizione nei mammiferi . Una regione regolatoria potenziatore attivo è in grado di interagire con la regione promotrice del suo gene bersaglio mediante la formazione di un anello cromosomico. Questo può avviare la sintesi dell'RNA messaggero (mRNA) da parte della RNA polimerasi II (RNAP II) legata al promotore nel sito di inizio della trascrizione del gene. L'ansa è stabilizzata da una proteina architettonica ancorata all'enhancer e una ancorata al promotore e queste proteine ​​sono unite per formare un dimero (zigzag rossi). Fattori di trascrizione regolatori specifici si legano ai motivi della sequenza del DNA sull'enhancer. I fattori di trascrizione generali si legano al promotore. Quando un fattore di trascrizione viene attivato da un segnale (qui indicato come fosforilazione mostrata da una piccola stella rossa su un fattore di trascrizione sull'enhancer) l'enhancer viene attivato e può ora attivare il suo promotore bersaglio. Il potenziatore attivo viene trascritto su ciascun filamento di DNA in direzioni opposte da RNAP II legati. Il mediatore (coattivatore) (un complesso costituito da circa 26 proteine ​​in una struttura interagente) comunica segnali regolatori dai fattori di trascrizione legati al DNA dell'enhancer al promotore.

L'espressione sovraregolata dei geni nei mammiferi inizia quando i segnali vengono trasmessi ai promotori associati ai geni. Le sequenze di DNA promotore possono includere diversi elementi come isole CpG (presenti in circa il 70% dei promotori), una scatola TATA (presente in circa il 24% dei promotori), iniziatore (Inr) (presente in circa il 49% dei promotori), upstream e elementi di riconoscimento TFIIB a valle (BREu e BREd) (presente in circa il 22% dei promotori), e elemento promotore del nucleo a valle (DPE) (presente in circa il 12% dei promotori). La presenza di più siti CpG metilati nelle isole CpG dei promotori provoca un silenziamento stabile dei geni. Tuttavia, gli esperimenti di Weingarten-Gabbay et al. hanno mostrato che la presenza o l'assenza degli altri elementi ha effetti relativamente piccoli sull'espressione genica. Due sequenze, TATA box e Inr, hanno causato piccoli ma significativi aumenti nell'espressione (aumenti rispettivamente del 45% e del 28%). Gli elementi BREu e BREd hanno ridotto significativamente l'espressione rispettivamente del 35% e del 20% e l'elemento DPE non ha rilevato alcun effetto sull'espressione.

I moduli regolatori cis che sono localizzati in regioni del DNA distanti dai promotori dei geni possono avere effetti molto grandi sull'espressione genica, con alcuni geni che subiscono un'espressione aumentata fino a 100 volte a causa di tale modulo regolatorio cis. Questi moduli cis-regolatori includono potenziatori , silenziatori , isolatori ed elementi di tethering. Tra questa costellazione di elementi, gli enhancer ei loro fattori di trascrizione associati hanno un ruolo di primo piano nella regolazione dell'espressione genica.

I potenziatori sono regioni del genoma che sono i principali elementi di regolazione genica. I potenziatori controllano i programmi di espressione genica specifici del tipo di cellula, il più delle volte attraversando lunghe distanze per arrivare in prossimità fisica con i promotori dei loro geni bersaglio. In uno studio sui neuroni corticali del cervello, sono stati trovati 24.937 loop, che portano potenziatori ai promotori. Molti potenziatori, ciascuno spesso a decine o centinaia di migliaia di nucleotidi distanti dai loro geni bersaglio, si collegano ai promotori del gene bersaglio e si coordinano tra loro per controllare l'espressione del loro gene bersaglio comune.

L'illustrazione schematica in questa sezione mostra un potenziatore che gira intorno per entrare in stretta vicinanza fisica con il promotore di un gene bersaglio. L'ansa è stabilizzata da un dimero di una proteina connettore (es. dimero di CTCF o YY1 ), con un membro del dimero ancorato al suo motivo di legame sull'enhancer e l'altro membro ancorato al suo motivo di legame sul promotore (rappresentato dal zigzag rossi nell'illustrazione). Diversi fattori di trascrizione specifici per la funzione cellulare (ci sono circa 1.600 fattori di trascrizione in una cellula umana) generalmente si legano a motivi specifici su un potenziatore e una piccola combinazione di questi fattori di trascrizione legati al potenziatore, quando viene avvicinata a un promotore da un anello del DNA, governa il livello di trascrizione del gene bersaglio. Il mediatore (coattivatore) (un complesso solitamente costituito da circa 26 proteine ​​in una struttura interagente) comunica segnali regolatori dai fattori di trascrizione legati al DNA dell'enhancer direttamente all'enzima RNA polimerasi II (pol II) legato al promotore.

I potenziatori, quando attivi, sono generalmente trascritti da entrambi i filamenti di DNA con le RNA polimerasi che agiscono in due direzioni diverse, producendo due eRNA come illustrato nella figura. Un potenziatore inattivo può essere legato a un fattore di trascrizione inattivo. La fosforilazione del fattore di trascrizione può attivarlo e quel fattore di trascrizione attivato può quindi attivare l'enhancer a cui è legato (vedi piccola stella rossa che rappresenta la fosforilazione del fattore di trascrizione legato all'enhancer nell'illustrazione). Un potenziatore attivato inizia la trascrizione del suo RNA prima di attivare un promotore per avviare la trascrizione dell'RNA messaggero dal suo gene bersaglio.

Bidirezionale (mammifero)

I promotori bidirezionali sono brevi regioni intergeniche (<1 kbp) di DNA tra le estremità 5' dei geni in una coppia di geni bidirezionali. Una "coppia di geni bidirezionale" si riferisce a due geni adiacenti codificati su filamenti opposti, con le loro estremità 5' orientate l'una verso l'altra. I due geni sono spesso funzionalmente correlati e la modifica della loro regione promotrice condivisa consente loro di essere co-regolati e quindi co-espressi. I promotori bidirezionali sono una caratteristica comune dei genomi dei mammiferi . Circa l'11% dei geni umani è accoppiato in modo bidirezionale.

I geni accoppiati in modo bidirezionale nel database Gene Ontology hanno condiviso almeno una categoria funzionale assegnata al database con i loro partner il 47% delle volte. L' analisi di microarray ha mostrato che i geni accoppiati in modo bidirezionale sono co-espressi in misura maggiore rispetto ai geni casuali o ai geni unidirezionali vicini. Sebbene la co-espressione non indichi necessariamente una co-regolazione, è stato dimostrato che la metilazione delle regioni del promotore bidirezionale sottoregola entrambi i geni e la demetilazione sovraregola entrambi i geni. Ci sono eccezioni a questo, tuttavia. In alcuni casi (circa 11%), viene espresso solo un gene di una coppia bidirezionale. In questi casi, il promotore è implicato nella soppressione del gene non espresso. Il meccanismo alla base di questo potrebbe essere la competizione per le stesse polimerasi o la modifica della cromatina . La trascrizione divergente potrebbe spostare i nucleosomi per sovraregolare la trascrizione di un gene o rimuovere i fattori di trascrizione legati per sottoregolare la trascrizione di un gene.

Alcune classi funzionali di geni hanno maggiori probabilità di essere accoppiate in modo bidirezionale rispetto ad altre. I geni implicati nella riparazione del DNA hanno una probabilità cinque volte maggiore di essere regolati da promotori bidirezionali che da promotori unidirezionali. Le proteine ​​chaperone sono tre volte più probabili e i geni mitocondriali sono più del doppio. Molti geni di base della pulizia e del metabolismo cellulare sono regolati da promotori bidirezionali. La sovrarappresentazione di geni di riparazione del DNA accoppiati in modo bidirezionale associa questi promotori al cancro . Il quarantacinque percento degli oncogeni somatici umani sembra essere regolato da promotori bidirezionali, significativamente più dei geni che non causano il cancro. L'ipermetilazione dei promotori tra le coppie di geni WNT9A /CD558500, CTDSPL /BC040563 e KCNK15 /BF195580 è stata associata a tumori.

Alcune caratteristiche di sequenza sono state osservate nei promotori bidirezionali, tra cui la mancanza di scatole TATA , l'abbondanza di isole CpG e una simmetria attorno al punto medio di C e A dominanti da un lato e di G e T dall'altro. Un motivo con la sequenza consenso di TCTCGCGAGA, chiamato anche elemento CGCG , ha recentemente dimostrato di guidare la trascrizione bidirezionale guidata da PolII nelle isole CpG. Le scatole CCAAT sono comuni, come lo sono in molti promotori che mancano di scatole TATA. Inoltre, i motivi NRF-1, GABPA , YY1 e ACTACAnnTCCC sono rappresentati nei promotori bidirezionali a tassi significativamente più elevati rispetto ai promotori unidirezionali. L'assenza di scatole TATA nei promotori bidirezionali suggerisce che le scatole TATA svolgono un ruolo nel determinare la direzionalità dei promotori, ma i controesempi di promotori bidirezionali possiedono scatole TATA e promotori unidirezionali senza di esse indica che non possono essere l'unico fattore.

Sebbene il termine "promotore bidirezionale" si riferisca specificamente alle regioni promotrici dei geni che codificano l' mRNA , i saggi della luciferasi hanno dimostrato che più della metà dei geni umani non hanno un forte bias direzionale. La ricerca suggerisce che gli RNA non codificanti sono frequentemente associati alle regioni promotrici dei geni che codificano l'mRNA. È stato ipotizzato che il reclutamento e l'inizio della RNA polimerasi II di solito inizino in modo bidirezionale, ma la trascrizione divergente viene interrotta a un checkpoint più tardi durante l'allungamento. I possibili meccanismi alla base di questa regolazione includono sequenze nella regione del promotore, modifica della cromatina e orientamento spaziale del DNA.

subgenomico

Un promotore subgenomico è un promotore aggiunto a un virus per uno specifico gene eterologo , con conseguente formazione di mRNA solo per quel gene. Molti virus a RNA a senso positivo producono questi mRNA subgenomici (sgRNA) come una delle tecniche di infezione comuni utilizzate da questi virus e generalmente trascrivono geni virali tardivi. I promotori subgenomici vanno da 24 nucleotidi ( virus Sindbis ) a oltre 100 nucleotidi ( virus della vena gialla necrotica della barbabietola ) e di solito si trovano a monte dell'inizio della trascrizione.

rilevamento

È stata sviluppata un'ampia varietà di algoritmi per facilitare il rilevamento dei promotori nella sequenza genomica e la previsione dei promotori è un elemento comune a molti metodi di previsione dei geni . Una regione del promotore si trova prima delle sequenze di consenso -35 e -10. Più la regione del promotore è vicina alle sequenze consenso, più spesso avrà luogo la trascrizione di quel gene. Non esiste un modello fisso per le regioni promotrici come per le sequenze consenso.

Cambiamento evolutivo

Sovrapposizione tra distribuzioni di promotori di Homo sapiens , Drosophila melanogaster , Oryza sativa e Arabidopsis thaliana . Le aree di colore rosso rappresentano sequenze promotrici conservate.

I cambiamenti nelle sequenze del promotore sono critici nell'evoluzione come indicato dal numero relativamente stabile di geni in molti lignaggi. Ad esempio, la maggior parte dei vertebrati ha all'incirca lo stesso numero di geni codificanti proteine ​​(circa 20.000) che sono spesso altamente conservati in sequenza, quindi gran parte del cambiamento evolutivo deve provenire da cambiamenti nell'espressione genica.

Origine de novo dei promotori

Date le brevi sequenze della maggior parte degli elementi promotori, i promotori possono evolvere rapidamente da sequenze casuali. Ad esempio, in E. coli , circa il 60% delle sequenze casuali può evolvere livelli di espressione paragonabili al promotore lac wild-type con una sola mutazione e che circa il 10% delle sequenze casuali può fungere da promotore attivo anche senza evoluzione.

Legame

Vedi anche: Attività del promotore

L'inizio della trascrizione è un processo sequenziale a più fasi che coinvolge diversi meccanismi: posizione del promotore, legame reversibile iniziale dell'RNA polimerasi, cambiamenti conformazionali nell'RNA polimerasi, cambiamenti conformazionali nel DNA, legame del nucleoside trifosfato (NTP) al promotore funzionale della RNA polimerasi inizio complesso, non produttivo e produttivo della sintesi dell'RNA.

Il processo di legame del promotore è cruciale nella comprensione del processo di espressione genica.

Posizione

Sebbene l' oloenzima della RNA polimerasi mostri un'elevata affinità per i siti non specifici del DNA, questa caratteristica non consente di chiarire il processo di localizzazione del promotore. Questo processo di localizzazione del promotore è stato attribuito alla struttura dell'oloenzima al DNA e sigma 4 ai complessi del DNA.

Malattie associate a funzioni aberranti

La maggior parte delle malattie ha cause eterogenee, il che significa che una "malattia" è spesso molte malattie diverse a livello molecolare, sebbene i sintomi esibiti e la risposta al trattamento possano essere identici. Il modo in cui le malattie di diversa origine molecolare rispondono ai trattamenti è parzialmente affrontato nella disciplina della farmacogenomica .

Non sono elencati qui i molti tipi di cancro che comportano una regolazione trascrizionale aberrante dovuta alla creazione di geni chimerici attraverso la traslocazione cromosomica patologica . È importante sottolineare che l'intervento nel numero o nella struttura delle proteine ​​legate al promotore è una chiave per trattare una malattia senza influenzare l'espressione di geni non correlati che condividono elementi con il gene bersaglio. Alcuni geni il cui cambiamento non è desiderabile sono in grado di influenzare il potenziale di una cellula di diventare cancerosa.

Isole CpG nei promotori

Articolo principale: Regolamento della trascrizione nel cancro

Nell'uomo, circa il 70% dei promotori localizzati vicino al sito di inizio della trascrizione di un gene (promotori prossimali) contiene un'isola CpG . Le isole CpG sono generalmente lunghe da 200 a 2000 paia di basi, hanno un contenuto di paia di basi C:G >50% e hanno regioni di DNA in cui un nucleotide citosina è seguito da un nucleotide guanina e questo si verifica frequentemente nella sequenza lineare di basi lungo il suo Direzione 5' → 3' .

I promotori distali contengono spesso anche isole CpG, come il promotore del gene di riparazione del DNA ERCC1 , dove il promotore contenente l'isola CpG si trova a circa 5.400 nucleotidi a monte della regione codificante del gene ERCC1 . Le isole CpG si verificano frequentemente anche nei promotori di RNA non codificanti funzionali come i microRNA .

La metilazione delle isole CpG silenzia stabilmente i geni

Nell'uomo, la metilazione del DNA avviene nella posizione 5' dell'anello pirimidinico dei residui di citosina all'interno dei siti CpG per formare 5-metilcitosine . La presenza di più siti CpG metilati nelle isole CpG dei promotori provoca un silenziamento stabile dei geni. Il silenziamento di un gene può essere avviato da altri meccanismi, ma questo è spesso seguito dalla metilazione dei siti CpG nell'isola del promotore CpG per causare il silenziamento stabile del gene.

Promotore CpG iper/ipo-metilazione nel cancro

Generalmente, nella progressione verso il cancro, centinaia di geni vengono silenziati o attivati . Sebbene il silenziamento di alcuni geni nei tumori avvenga per mutazione, gran parte del silenziamento genico cancerogeno è il risultato di un'alterata metilazione del DNA (vedi metilazione del DNA nel cancro ). La metilazione del DNA che causa il silenziamento nel cancro si verifica tipicamente in più siti CpG nelle isole CpG che sono presenti nei promotori dei geni codificanti proteine.

Espressioni alterate di microRNA silenziano o attivano anche molti geni in progressione verso il cancro (vedi microRNA nel cancro ). Espressione microRNA Altered avviene attraverso iper / ipo-metilazione di siti CpG in isole CpG a promotori che controllano la trascrizione dei microRNA .

Il silenziamento dei geni di riparazione del DNA attraverso la metilazione delle isole CpG nei loro promotori sembra essere particolarmente importante nella progressione verso il cancro (vedi metilazione dei geni di riparazione del DNA nel cancro ).

Sequenze canoniche e wild-type

L'uso del termine sequenza canonica per riferirsi a un promotore è spesso problematico e può portare a malintesi sulle sequenze del promotore. Canonico implica perfetto, in un certo senso.

Nel caso di un sito di legame del fattore di trascrizione, potrebbe esserci una singola sequenza che lega la proteina più fortemente in condizioni cellulari specificate. Questo potrebbe essere chiamato canonico.

Tuttavia, la selezione naturale può favorire un legame meno energetico come modo per regolare l'output trascrizionale. In questo caso, possiamo chiamare la sequenza wild-type la sequenza più comune in una popolazione. Potrebbe non essere nemmeno la sequenza più vantaggiosa da avere nelle condizioni prevalenti.

Prove recenti indicano anche che diversi geni (incluso il proto-oncogene c-myc ) hanno motivi G-quadruplex come potenziali segnali regolatori.

Malattie che possono essere associate a variazioni

Alcuni casi di molte malattie genetiche sono associati a variazioni dei promotori o dei fattori di trascrizione.

Esempi inclusi:

Costitutivo vs regolamentato

Alcuni promotori sono detti costitutivi in ​​quanto sono attivi in ​​ogni circostanza nella cellula, mentre altri sono regolati , divenendo attivi nella cellula solo in risposta a stimoli specifici.

Uso del termine

Quando si fa riferimento a un promotore alcuni autori in realtà intendono promotore + operatore ; cioè, il promotore lac è inducibile da IPTG, il che significa che oltre al promotore lac, è presente anche l'operatore lac. Se l'operatore lac non fosse presente, l' IPTG non avrebbe un effetto inducibile. Un altro esempio è il sistema Tac-Promoter (Ptac). Nota come tac è scritto come promotore di tac, mentre in realtà tac è in realtà sia un promotore che un operatore.

Guarda anche

Riferimenti

link esterno