XPC (gene) - XPC (gene)

XPC
Proteina XPC PDB 2A4J.png
Strutture disponibili
PDB Ricerca ortologa: PDBe RCSB
Identificatori
Alias XPC , RAD4, XP3, XPCC, p125, xeroderma pigmentoso, gruppo di complementazione C, subunità del complesso XPC, riconoscimento del danno al DNA e fattore di riparazione
ID esterni OMIM : 613208 MGI : 103557 OmoloGene : 3401 Schede Genetiche : XPC
Ortologhi
Specie Umano Topo
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001145769
NM_004628

NM_009531

RefSeq (proteine)

NP_004619
NP_001341655
NP_001341656
NP_001341658
NP_001341659

NP_033557

Posizione (UCSC) n / A Chr 6: 91.49 – 91.52 Mb
Ricerca PubMed
Wikidata
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Xeroderma pigmentosum, gruppo di complementazione C , noto anche come XPC , è una proteina che nell'uomo è codificata dal gene XPC . XPC è coinvolto nel riconoscimento di addotti di DNA voluminosi nella riparazione dell'escissione di nucleotidi . Si trova sul cromosoma 3.

Funzione

Questo gene codifica per un componente della via di riparazione dell'escissione dei nucleotidi (NER). Ci sono più componenti coinvolti nel percorso NER, tra cui Xeroderma pigmentoso (XP) AG e V, sindrome di Cockayne (CS) A e B e tricotiodistrofia (TTD) gruppo A, ecc. Questo componente, XPC, svolge un ruolo importante nel prime fasi del genoma globale NER, in particolare nel riconoscimento dei danni, nella formazione di complessi aperti e nella riparazione della formazione di complessi proteici.

Il complesso di XPC-RAD23B è il fattore di riconoscimento del danno iniziale nella riparazione per escissione di nucleotidi genomici globali (GG-NER). XPC-RAD23B riconosce un'ampia varietà di lesioni che destabilizzano termodinamicamente i duplex del DNA, compresi i fotoprodotti indotti dai raggi UV (dimeri di ciclopirimidina e 6-4 fotoprodotti), gli addotti formati da mutageni ambientali come il benzo[a]pirene o varie ammine aromatiche, alcuni ossidanti endogeni lesioni come ciclopurine e addotti formati da farmaci chemioterapici antitumorali come il cisplatino. La presenza di XPC-RAD23B è necessaria per l'assemblaggio degli altri fattori NER fondamentali e la progressione attraverso la via NER sia in vitro che in vivo. Sebbene la maggior parte degli studi sia stata eseguita con XPC-RAD23B, fa parte di un complesso trimerico con centrina-2, una proteina legante il calcio della famiglia della calmodulina.

Significato clinico

Le mutazioni in questo gene o in alcuni altri componenti del NER determinano lo Xeroderma pigmentoso , una rara malattia autosomica recessiva caratterizzata da una maggiore sensibilità alla luce solare con lo sviluppo di carcinomi in tenera età.

Cancro

Il danno al DNA sembra essere la causa principale del cancro e le carenze nei geni di riparazione del DNA sono probabilmente alla base di molte forme di cancro. Se la riparazione del DNA è carente, il danno al DNA tende ad accumularsi. Tale danno al DNA in eccesso può aumentare le mutazioni a causa della sintesi di traslezione soggetta a errori . Il danno eccessivo al DNA può anche aumentare le alterazioni epigenetiche dovute a errori durante la riparazione del DNA. Tali mutazioni e alterazioni epigenetiche possono dare origine al cancro .

Le riduzioni nell'espressione dei geni di riparazione del DNA (di solito causate da alterazioni epigenetiche come l'ipermetilazione del promotore) sono molto comuni nei tumori e sono normalmente molto più frequenti dei difetti mutazionali nei geni di riparazione del DNA nei tumori. La tabella seguente mostra che l'espressione di XPC è stata frequentemente ridotta epigeneticamente nel cancro della vescica e anche nel cancro del polmone non a piccole cellule, e mostra anche che l'XPC è stato ridotto più frequentemente negli stadi più avanzati di questi tumori.

Frequenza di ridotta espressione di XPC nei tumori, con stadi dei tumori indicati separatamente
Cancro Frequenza Rif.
Cancro alla vescica 50%
Neoplasia uroteliale papillare di basso potenziale maligno 35%
Cancro della vescica papillare di basso grado 42%
Cancro della vescica papillare di alto grado 65%
Carcinoma polmonare non a piccole cellule (NSCLC) 70%
NSCLC Fase I 62%
NSCLC stadi II-III 77%

Mentre è stato dimostrato che l'ipermetilazione epigenetica della regione del promotore del gene XPC è associata a una bassa espressione di XPC, un'altra modalità di repressione epigenetica di XPC può verificarsi anche per sovraespressione del microRNA miR-890.

Interazioni

È stato dimostrato che XPC (gene) interagisce con ABCA1 , CETN2 e XPB .

Riferimenti

Ulteriori letture

link esterno