DDB1 - DDB1

DDB1
Strutture disponibili
PDB	Ricerca ortologa: PDBe RCSB
Elenco dei codici ID PDB
	2B5L , 2B5M , 2B5N , 2HYE , 3E0C , 3EI1 , 3EI2 , 3EI3 , 3EI4 , 3I7H , 3I7K , 3I7L , 3I7N , 3I7O , 3I7P , 3I89 , 3I8C , 3I8E , 4A08 , 4A09 , 4A0A , 4A0B , 4A0K , 4A0L , 4A11 , 4CI1 , 4CI2 , 4CI3 , 4E54 , 4E5Z , 4TZ4 , 5FQD , 5HXB
Identificatori
Alias	DDB1 , DDBA, UV-XAP1, XPCE, XPE, XPE-BF, danneggiano la proteina legante il DNA specifico 1
ID esterni	OMIM : 600045 MGI : 1202384 HomoloGene : 1448 GeneCards : DDB1
Localizzazione del gene ( umano )
Cr.	Cromosoma 11 (umano)
Fine	61.342.596 bp
Localizzazione del gene ( Mouse )
Cr.	Cromosoma 19 (topo)
Fine	10.629.819 bp
Ontologia genica
Funzione molecolare	• legame al DNA ; • GO: 0001948 proteina legante ; • legame degli acidi nucleici ; • DNA danneggiato vincolante ; • attività di adattatore proteina-macromolecola ; • cullin legame con le proteine della famiglia ; • dominio WD40-repeat binding ; • GO: 0.032.403 proteine contenenti complesso vincolante;
Componente cellulare	• citoplasma ; • nucleoplasm ; • Cul4A-RING E3 ubiquitina ligasi complesso ; • Cul4B-RING E3 ubiquitina ligasi complesso ; • extracellulare exosome ; • nucleo ; • spazio extracellulare ; • Cul4-RING E3 ubiquitina ligasi complesso ; • contenenti proteine complesse;
Processo biologico	• regolazione della transizione di fase del ciclo cellulare mitotico ; • riparazione per escissione di nucleotidi ; • riparazione per escissione di nucleotidi, riconoscimento del danno al DNA ; • regolazione positiva da parte del virus dei livelli di proteine virali nella cellula ospite ; • monoubiquitinazione dell'istone H2A ; • regolazione negativa del processo apoptotico ; • via di segnalazione Wnt ; • globale riparazione per escissione di nucleotidi del genoma ; • processo biologico coinvolto nell'interazione con il simbionte ; • regolazione positiva del rilascio virale dalla cellula ospite ; • regolazione positiva della replicazione del genoma virale ; • riparazione per escissione di nucleotidi accoppiata alla trascrizione ; • GO:0022415 processo virale ; • riparazione per escissione di nucleotidi, DNA incisione ; • UV-riparare i danni escissione ; • riparazione del DNA ; • proteasoma-mediata ubiquitina-dipendente processo catabolico proteina ; • risposta al danno del DNA, il rilevamento del danno al DNA ; • riparazione nucleotide-escissione, incisione DNA, 3'-di lesione ; • riparazione nucleotide-escissione, preincision stabilizzazione complessa ; • riparazione per escissione di nucleotidi, srotolamento del duplex del DNA ; • riparazione per escissione di nucleotidi, preincisione c assemblaggio complesso ; • riparazione per escissione di nucleotidi, incisione del DNA, 5'-a lesione ; • modificazione proteica post-traduzionale ; • processo catabolico proteasomico ; • risposta cellulare allo stimolo di danno al DNA ; • ubiquitinazione proteica ; • regolazione positiva del processo catabolico proteico ; • catabolico proteico ubiquitina-dipendente processo ; • regolazione del ritmo circadiano ; • regolazione positiva della gluconeogenesi ; • processo ritmico;
	Fonti: Amigo / QuickGO
Ortologhi
	1642
	13194
	ENSG00000167986
	ENSMUG00000024740
	Q16531
	Q3U1J4
	NM_001923
	NM_015735
	NP_001914
	NP_056550
	Wikidata
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La proteina 1 che lega il danno al DNA è una proteina che nell'uomo è codificata dal gene DDB1 .

Gene

La posizione del gene è sul cromosoma 11q12-q13.

Proteina

Il gene DDB1 codifica per la subunità grande della proteina che lega il danno al DNA , un eterodimero composto da una subunità grande e una piccola ( DDB2 ). DDB1 contiene 1140 amminoacidi, per una massa di 127 kDa.

Funzione

Come suggerisce il nome, DDB1 è stato inizialmente implicato nel processo di un tipo specifico di riparazione del DNA noto come riparazione per escissione di nucleotidi . Da allora, i ricercatori hanno scoperto che DDB1 funziona principalmente come un componente fondamentale del CUL4A - e CUL4B -based E3 ubiquitina ligasi complessi. DDB1 funge da ponte o proteina adattatrice che interagisce con dozzine di proteine note come fattori associati a DDB1 e CUL4 (DCAF). Questi DCAF sono spesso substrati di ubiquitina ligasi e regolano numerosi processi essenziali nella cellula tra cui la riparazione del DNA (DDB2), la replicazione del DNA, il rimodellamento della cromatina ( Cdt2 ) e altro.

Interazioni

È stato dimostrato che DDB1 interagisce con l' omologo della proteina di inizio della trascrizione SPT3 , GCN5L2 , DDB2 , CUL4A , CUL4B e P21 .

Riferimenti

Ulteriori letture

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