Brachypodium distachyon - Brachypodium distachyon
Brachypodium distachyon | |
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Classificazione scientifica | |
Regno: | Plantae |
Clade : | Tracheofite |
Clade : | Angiosperme |
Clade : | Monocotiledoni |
Clade : | Commelinidi |
Ordine: | Poales |
Famiglia: | Poaceae |
Sottofamiglia: | Pooideae |
Genere: | Brachypodium |
Specie: |
B. distachyon
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Nome binomiale | |
Brachypodium distachyon |
Il Brachypodium distachyon , comunemente chiamato falso bromo viola o bromo rigido , è una specie erbacea originaria dell'Europa meridionale , dell'Africa settentrionale e dell'Asia sud - occidentale a est dell'India . È correlato alle principali specie di cereali: grano , orzo , avena , mais , riso , segale , sorgo e miglio . Ha molte qualità che lo rendono un eccellente organismo modello per la ricerca genomica funzionale in erbe temperate , cereali e colture di biocarburanti dedicate come il panico verga . Questi attributi includono accessioni diploidi di piccoli genomi (~ 270 Mbp) , una serie di accessioni poliploidi , una bassa statura fisica, autofertilità, un ciclo di vita breve, semplici requisiti di crescita e un sistema di trasformazione efficiente. Il genoma di Brachypodium distachyon (linea diploide inbred Bd21) è stato sequenziato e pubblicato su Nature nel 2010.
Organismo modello
Sebbene il Brachypodium distachyon abbia poca o nessuna rilevanza agricola diretta , presenta diversi vantaggi come organismo modello sperimentale per la comprensione della biologia genetica , cellulare e molecolare delle erbe temperate . Le dimensioni relativamente ridotte del suo genoma lo rendono utile per la mappatura e il sequenziamento genetico . Inoltre, solo il 21% circa del genoma del Brachypodium è costituito da elementi ripetitivi, rispetto al 26% nel riso e all'80% circa nel grano, semplificando ulteriormente la mappatura e il sequenziamento genetico. Con circa 272 milioni di paia di basi e con cinque cromosomi , ha un piccolo genoma per una specie di erba. Anche le piccole dimensioni (15-20 cm) e il ciclo di vita rapido (da otto a dodici settimane) del Brachypodium distachyon sono vantaggiosi per scopi di ricerca. Per le accessioni a fioritura precoce possono essere necessarie anche tre settimane dalla germinazione alla fioritura (con un fotoperiodo induttivo appropriato ). Le ridotte dimensioni di alcune accessioni lo rendono comodo per la coltivazione in poco spazio. Come erba cresce facilmente senza condizioni di crescita specializzate.
Questo Brachypodium sta emergendo come un potente modello con una crescente comunità di ricerca. L'International Brachypodium Initiative (IBI) ha tenuto il suo primo meeting e workshop sulla genomica alla conferenza PAG XIV a San Diego, California , nel gennaio 2006. L'obiettivo dell'IBI è promuovere lo sviluppo di B. distachyon come sistema modello e svilupperà e distribuire risorse genomiche, genetiche e bioinformatiche come genotipi di riferimento , librerie BAC, marcatori genetici, popolazioni di mappatura e un database di sequenze genomiche. Recentemente, sono stati sviluppati efficienti sistemi di trasformazione mediata da Agrobacterium per una serie di genotipi Brachypodium , consentendo lo sviluppo di collezioni di mutanti T-DNA . La caratterizzazione e la distribuzione delle linee di inserzione del T-DNA è stata avviata per facilitare la comprensione della funzione genica nelle graminacee.
Ormai, Brachypodium distachyon si è affermato come uno strumento importante per la genomica comparativa . Ora sta emergendo come modello per la malattia delle piante coltivate, facilitando il trasferimento da modello a raccolto di conoscenze sulla resistenza alle malattie. Brachypodium distachyon sta diventando anche un utile sistema modello per studi di biologia evolutiva dello sviluppo , in particolare per contrastare i meccanismi genetici molecolari con sistemi modello dicotiledoni, in particolare Arabidopsis thaliana . La scoperta di una maggiore diversità genetica nelle popolazioni iberiche orientali che si verificano nei suoli di base suggerisce che queste popolazioni possono essere adattate meglio di quelle che si verificano nelle aree occidentali della penisola iberica, dove i suoli sono più acidi e accumulano ioni Al tossici.
Appunti
Riferimenti
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link esterno
- www.brachypodium.org - The Brachypodium distachyon Information Resource.
- www.brachybase.org - The Brachypodium distachyon Genome Browser and Annotation Database.
- " Brachypodium distachyon " . Germplasm Resources Information Network (GRIN) . Servizio di ricerca agricola (ARS), Dipartimento dell'agricoltura degli Stati Uniti (USDA).