SARS-CoV-2 variante Epsilon - SARS-CoV-2 Epsilon variant

Paesi con casi confermati di variante Epsilon al 1 luglio 2021 (GISAID)
Legenda:

  10.000+ sequenze confermate

  1000-9999 sequenze confermate

  100-999 sequenze confermate

  10-99 sequenze confermate

  2-9 sequenze confermate

  1 sequenza confermata

  Nessuno o nessun dato disponibile

La variante di Epsilon , nota anche come CAL.20C e riferita a due linee PANGO B.1.427 e B.1.429 , è una delle varianti di SARS-CoV-2 , il virus che causa il COVID-19 . È stato rilevato per la prima volta in California , negli Stati Uniti, nel luglio 2020.

A partire da luglio 2021, Epsilon non è più considerato una variante di interesse dall'OMS.

mutazioni

La variante ha cinque mutazioni definenti (I4205V e D1183Y nel gene ORF1ab e S13I, W152C, L452R nel gene S della proteina spike ), di cui l'L452R (in precedenza rilevato anche in altri lignaggi non correlati) era particolarmente preoccupante . B.1.429 è forse più trasmissibile rispetto alle precedenti varianti circolanti localmente, ma sono necessari ulteriori studi per confermarlo. I Centri per il controllo e la prevenzione delle malattie (CDC) hanno elencato B.1.429 e il relativo B.1.427 come " varianti di preoccupazione " e cita una prestampa per affermare che mostrano un aumento del 20% circa della trasmissibilità virale, che hanno un " Impatto significativo sulla neutralizzazione da parte di alcune, ma non tutte le terapie che hanno ottenuto l' autorizzazione all'uso di emergenza (EUA) dalla Food and Drug Administration (FDA) per il trattamento o la prevenzione di COVID-19 e che riducono moderatamente la neutralizzazione da parte del plasma raccolto da persone che sono state precedentemente infettate dal virus o che hanno ricevuto un vaccino contro il virus. Nel maggio 2021, l' Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) ha dato alla variante il nuovo nome "Variante Epsilon".

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  Mutazioni aminoacidiche della variante Epsilon di SARS-CoV-2 tracciate su una mappa del genoma di SARS-CoV-2 con un focus sul picco.

Parte di una serie sul
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Storia

Epsilon (CAL.20C) è stato osservato per la prima volta nel luglio 2020 dai ricercatori del Cedars-Sinai Medical Center , in California , in uno dei 1.230 campioni di virus raccolti nella contea di Los Angeles dall'inizio dell'epidemia di COVID-19 . Non è stato più rilevato fino a settembre, quando è riapparso tra i campioni in California, ma i numeri sono rimasti molto bassi fino a novembre. Nel novembre 2020, la variante Epsilon rappresentava il 36% dei campioni raccolti presso il Cedars-Sinai Medical Center e, nel gennaio 2021, la variante Epsilon rappresentava il 50% dei campioni. In un comunicato stampa congiunto da University of California, San Francisco , California Dipartimento di Sanità Pubblica e di Santa Clara County Public Health Department , è stato annunciato che la variante è stata anche rilevata in diverse contee della California del Nord. Da novembre a dicembre 2020, la frequenza della variante nei casi sequenziati della California settentrionale è passata dal 3% al 25%. In una prestampa, CAL.20C è descritto come appartenente al Nextstrain clade 20C e contribuisce per circa il 36% dei campioni, mentre una variante emergente dal clade 20G rappresenta circa il 24% dei campioni in uno studio incentrato sulla California meridionale. Si noti tuttavia che negli Stati Uniti nel complesso, il clade 20G predomina, a partire da gennaio 2021. A seguito del crescente numero di Epsilon in California, la variante è stata rilevata a frequenze variabili nella maggior parte degli stati degli Stati Uniti. Piccoli numeri sono stati rilevati in altri paesi del Nord America e in Europa, Asia e Australia. A luglio 2021, la variante Epsilon era stata rilevata in 45 paesi, secondo GISAID . Dopo un aumento iniziale, la sua frequenza è rapidamente diminuita da febbraio 2021 poiché veniva superata dalla variante Alpha più trasmissibile . Ad aprile, Epsilon è rimasto relativamente frequente in alcune parti della California settentrionale, ma era praticamente scomparso dal sud dello stato e non era mai stato in grado di stabilire un punto d'appoggio altrove; solo il 3,2% di tutti i casi negli Stati Uniti erano Epsilon, mentre a quel punto più di due terzi erano Alpha.

Statistiche

Guarda anche

• SARS-CoV-2 variante alfa
• Variante beta di SARS-CoV-2
• SARS-CoV-2 Variante gamma
• SARS-CoV-2 variante Delta
• SARS-CoV-2 Variante Theta
• SARS-CoV-2 variante Kappa
• Varianti di SARS-CoV-2

Riferimenti